Pada masa sekarang ini hingga satu dekade ke depan, para peneliti akan dihadapkan pada tantangan penyimpanan, pengolahan dan analisis data besar (big data) yang dihasilkan dari teknologi Next-Generation Sequencing (NGS). Analisis sekuen genom menggunakan pendekatan NGS merupakan proses konversi dari materi biologis belum bermakna (sampel DNA atau RNA) menjadi kode informasi (kode biner dan kode basa nukleotida) dan diterjemahkan menjadi informasi biologis bermakna. Bioinformatika terlibat secara nyata dan memiliki peran sangat penting dalam rangka mempermudah setiap tahapan analisis NGS.

Bioinformatika merupakan bagian yang tidak terpisahkan dari teknologi sekuensing generasi baru atau yang sering disebut Next-Generation Sequencing (NGS). Pada masa sekarang ini hingga satu dekade ke depan, para peneliti akan dihadapkan pada tantangan penyimpanan, pengolahan dan analisis data besar (big data) yang dihasilkan dari teknologi NGS [1]. Setidaknya, empat tahapan wajib dilakukan dalam analisis sekuen nukleotida menggunakan platform NGS yaitu (1) pemanggilan basa (base calling) pasca sekuensing, (2) penjajaran dan penggabungan sekuen (assembly), (3) anotasi sekuen (annotation), dan (4) integrasi data bioinformatika menjadi data biologis (data integration).

Institut Pertanian Bogor (IPB) merayakan hari kelulusan mahasiswa dan mahasiswi terbaiknya pada hari Rabu, 13 September 2017, di Gedung Graha Widya Wisuda, Kampus IPB Darmaga Bogor. Wisuda Tahap I tahun akademik 2017/2018 kali ini berhasil meluluskan 750 orang mahasiswa/i terbaik yang terdiri dari 13 lulusan bergelar Doktor, 81 lulusan bergelar Magister Sains, 15 lulusan bergelar Magister Manajemen, 3 lulusan bergelar Magister Profesional, 13 lulusan bergelar Dokter Hewan, dan 622 lulusan bergelar Sarjana.

Hingga saat ini, menurut data, alumni IPB tercatat mencapai 146.150 orang yang tersebar di seluruh wilayah Indonesia. Selain itu, acara wisuda dihadiri oleh beberapa perwakilan alumni IPB yang telah sukses baik di dalam maupun luar negeri seperti Gubernur Jambi, Zumi Zola Zulkifli, yang diundang sebagai alumni IPB. Adapun kata sambutan disampaikan oleh Direktur PPBBI, Dr. Ir. Priyono, DIRS sebagai perwakilan Dewan Pakar Himpunan Alumni IPB.

Bioinformatika aplikatif sangat menjanjikan dan telah memberikan kontribusi dalam percepatan riset pada berbagai bidang riset. Meskipun demikian, minat peneliti-peneliti di Indonesia untuk melaksanakan riset terkait bioinformatika masih belum tinggi. Hal tersebut diperlihatkan pada laju akses traffic ke dalam basis data publik internasional masih dibawah 1% (kategori sangat minim) dari total traffic per tahunnya di Indonesia.

Sejak tahun 2012, Pusat Penelitian Informatika LIPI telah membangun fasilitas komputasi berkinerja tinggi atau disebut dengan High Performance Computer (HPC) (http://grid.lipi.go.id) yang bersifat terbuka untuk riset. HPC tersebut merupakan sarana komputasi parallel dengan memanfaatkan klaster komputer berbasis Linux. HPC LIPI dibangun berdasarkan kebutuhan komputasi untuk menyelesaikan berbagai masalah riset dengan tiga pendekatan yaitu (1) menggunakan teori yang kompleks tanpa suatu solusi tunggal untuk menyelesaikan persamaan atau masalah yang hanya dapat diselesaikan secara numeris, (2) melakukan percobaan virtual yang ‘tidak mungkin’ dimana kondisi batasnya tidak dapat dikendalikan, dan (3) melakukan pengukuran atas kebenaran suatu model atau teori.

Jika kita menemukan serangga mati yang tubuhnya mengeras dan seperti diselimuti kapas, maka kemungkinan besar serangga tersebut terjerat oleh fungi pathogen. Pada dasarnya fungi merupakan organisme yang memperoleh makanannya dari organisme lain (heterotrof). Makanan fungi dapat berasal dari organisme yang sudah mati (fungi saprob) dan atau organisme yang masih hidup. Fungi yang memperoleh makannya dari organisme hidup dapat bersifat menguntungkan atau pun merugikan (parasit). Kebanyakan dari kita pasti mengira jika fungi parasit itu buruk. Namun, pada kenyataannya tidak semua fungi parasit itu buruk. Beberapa diantaranya dapat menguntungkan bagi manusia, seperti Beauveria bassiana. Beauveria bassiana merupakan fungi penjerat serangga yang ampuh untuk mengendalikan hama tanaman.

Latisifer adalah sel yang terdiferensiasi khusus dan dicirikan oleh karakteristik anatomi yang unik dan sitoplasma yang berbeda. Latisifer tidak hanya dimiliki oleh tanaman karet (Hevea brasiliensis) namun juga telah dilaporkan terdapat pada lebih dari 12.500 spesies tanaman. Latisifer tidak hanya berperan sebagai tempat penyimpanan produk alami pada tanaman (terpenoid, isopren, dan alkaloid) namun juga berbagai proteom. Sebagai kesimpulan, latisifer tidak dipungkiri lagi memiliki kontribusi yang besar pada tanaman untuk mensintesis dan menyimpan toksin atau bioproduk yang dapat digunakan untuk kepentingan manusia pada skala industri.

Latisifer adalah sel yang terdiferensiasi khusus dan dicirikan oleh karakteristik anatomi yang unik dan sitoplasma yang berbeda. Sitoplasma ini disebut sebagai lateks. Sejak zaman primitif, senyawa yang terkandung di dalam latisifer telah menjadi bioproduk tradisional yang berharga. Kebudayaan Aborigin di Asia Tenggara telah menggunakan eksudat dari Antiaris spp. yang mengandung glikosida jantung sebagai bahan ramuan racun pada panah mereka [2]. Latisifer pada tanaman opium (Papaver somniferum) mensintesis opium yang banyak disalahgunakan sebagai narkotika [3]. Latisifer juga telah diketahui memegang andil dalam biosintesis metabolit khusus seperti pada tanaman Catharanthus roseus [4]. Yang terakhir tentu saja, latisifer merupakan komponen sel yang sangat berharga pada tanaman karet (Hevea brasiliensis) dan fig karet (Ficus elastica) sebagai sumber komersial karet alam [5].

Trips (Ordo Thysanoptera) merupakan ordo serangga yang menjadi hama penting pada berbagai komoditas pertanian. Pada kelapa sawit, hama trips memiliki peran ganda (double agent) sebagai polinator yang cukup penting. Spesies trips yang ditemukan berperan sebagai polinator pada kelapa sawit adalah Thrips hawaiiensis (Morgan). Spesies trips ini merupakan hama polifag yang menyerang berbagai jenis tanaman dari mulai hortikultura, tanaman hias, hingga tanaman perkebunan. Trips pada kelapa sawit, kawan atau lawan?

Sejatinya, tidak ada satu pun organisme yang masuk ke dalam kelompok hama tanaman. Istilah hama tanaman muncul ketika suatu komoditas atau tanaman berhubungan dengan kepentingan manusia. Organisme yang kita labeli dengan nama hama sebenarnya hanya melakukan aktivitasnya untuk bertahan hidup. Dibalik itu semua, tentu ada peran lain dari organisme tersebut didalam ekosistem secara keseluruhan. Paling tidak, mereka merupakan bagian dari jejaring makanan yang ada. Trips selain berperan sebagai hama juga dapat berperan sebagai polinator pada berbagai jenis tanaman, terutama trips yang hidup pada bunga. Hal ini berhubungan dengan sifat trips yang menyukai polen sebagai makanannya. Selain pada bunga, trips juga hidup pada kelopak bunga, daun, dan batang.